Фильм Сомнение

Бронкс, Нью-Йорк. 1984 год. Мальчики Дональд Миллер и Джимми Хёрли, служащие алтарниками в местной церкви, подготавливают всё необходимое для грядущей проповеди отца Флинна. Во время службы священник рассказывает о сомнениях. На задних рядах проповедь слушает сестра Элоиза, директриса школы при церкви. После окончания выступления к Флинну подходит Дональд, сообщающий, что тоже хочет быть священником. Мужчина дарит ему игрушку.

На следующий день начинаются очередные занятия в католической школе. Во время урока истории у молодой сестры Джеймс в классную комнату заходит сестра Элоиза. Она отнимает у одного из ребят карманное радио. Вечером монахини ужинают в молчании за столом. Сестра Элоиза просит женщин внимательнее присмотреться к отцу Флинну, который насторожил её своим рассказом о сомнениях. Элоиза расспрашивает Джеймс о её работе с учениками, призывая монахиню быть строже. В окне директриса рассматривает отца Флинна, развязно болтающего с другим священником. В этот же день отец Флинн после проведения урока физкультуры для мальчиков ужинает с другими мужчинами-служителями, выпивая алкоголь и отпуская между собой шуточки. Монахини же, в свою очередь, продолжают обедать в тишине.

Во время урока истории сестре Джеймс звонит отец Флинн, который просит Дональда зайти к нему. После занятий дети учатся танцевать. Наблюдающая за этим сестра Джеймс замечает отца Флинна, который кладёт одежду Дональда, в которой он занимался физкультурой, к нему в шкафчик. Сам же Дональд приходит в класс к сестре в подавленном состоянии. Джеймс идёт поговорить о Миллере с директрисой. Она рассказывает, что отец Флинн очень близко общается с чернокожим мальчиком, выступая его покровителем. Сестра Элоиза, подозревающая священника в развращении ученика, выслушивает от Джеймс о странном состоянии мальчика после встречи с отцом. Также учительница сообщает, что от Миллера пахло алкоголем. Директриса пытается придумать, как выяснить правду об отношениях Дональда и священнослужителя.

На следующий день под предлогом разговора о рождественской постановке Флинна приглашают в кабинет к директрисе. Постепенно во время беседы священник начинает улавливать истинную тему разговора, когда Элоиза начинает расспрашивать его о Дональде Миллере. Продолжая намекать на тесную связь мальчика и мужчины, Элоиза просит Флинна поведать о разговоре, на который тот вызвал Миллера с урока. Возмущенный подозрениями священник, не желая отвечать, собирается уйти, но Элоиза рассказывает о запахе алкоголя, который почувствовала сестра Джеймс. Миллер сознаётся, что Дональд выпил вино для причастия, за что его должны исключить из алтарников. Тем самым, по его словам, скрывая это, он хотел защитить мальчика, чтобы оставить его на службе. После ухода отца в ответ на радость Джеймс по поводу рассказанного Элоиза признаётся, что не верит в услышанную историю. Возмущенная молодая монахиня высказывает директрисе свои мысли. По её мнению Элоизе просто не нравится Флинн по личным причинам и она лишь только ищет повод, как избавиться от мужчины. Элоиза успокаивает её и звонит маме Дональда.

После новой церковной проповеди о греховности сплетен Флинн общается с Джеймс на лавочке у школы. Она спрашивает священника про увиденный случай со шкафчиком после танцев. Флинн убеждает монахиню в своей честности, уверяя её в том, что с детьми надо общаться иначе, чем это делает директриса. Он убеждает сестру поехать к её больному брату, письмо от которого Джеймс недавно получила.

В коридоре школы Дональд замечает отца Флинна, но тот быстро уходит в соседний кабинет. Тут же мальчика толкают и ломают подаренную ранее священником игрушку. Флинн подходит успокоить плачущего Миллера, помогая тому собраться и уводя в сторону. Во время очередного урока сестра Джеймс срывается на учениках. Тем временем к директрисе приходит миссис Миллер, мама Дональда. Её замечает отец Флинн. Миссис Миллер рассказывает о том, как сильно её сын восхищается Флинном. Элоиза же сообщает женщине о своих подозрениях в растлении Дональда. Но, к её удивлению, миссис Миллер не желает слушать об этом. Под напором монахини женщина со слезами на глазах признаётся, что «её сын - не такой как все», и что мальчик и так настрадался в прошлой школе, а отец Флинн сейчас является единственным человеком, кто относится к Дональду хорошо. Женщина боится своего мужа, который, если узнает о чём-то подобном, буквально убьёт сына. Она просит сестру Элоизу не вмешивать её в это, не создавать новых проблем и оставить всё, как есть до июня, когда Дональд уже закончит школу и уйдёт в другую.

Невзирая на услышанное сестра Элоиза не планирует отступаться. Во время очередной беседы с отцом Флинном в кабинете она, не имея никаких доказательств, прямо сообщает ему о своих мыслях. Несмотря на все слова Флинна ему никак не удаётся разуверить женщину в подозрениях. Элоиза рассказывает, что позвонила в бывший приход священника и расспросила о нём местную монахиню, которая сообщила ей все подробности прошлого мужчины. Возмущенный Флинн обвиняет сестру в личной неприязни к себе. Уверенная в собственной правоте Элоиза обещает сделать всё, чтобы изгнать отца из церкви. Флинн, продолжая стоять на своей невиновности, понимает, что Элоиза не отступится, и поэтому решается уйти сам.

Проходит время. Вернувшаяся от брата сестра Джеймс замечает во дворе на скамейке Элоизу. Директриса признаётся монахине, что соврала священнику по поводу звонка. По её словам, если бы Флинн был невиновен, то он бы не ушёл. Тем не менее, несмотря на все слухи о поведении мужчины, отца Флинна повышают в должности в новом приходе. Джеймс спрашивает, получилось ли у Элоизы доказать правдивость своих подозрений хоть кому-то ещё, кроме самой себя. Внезапно сестра Элоиза начинает плакать и признаётся, что, несмотря на всю уверенность, у неё всё же есть сомнения в виновности Флинна.