Андрей Шавкеро родился 27 ноября 1985 года.
Шавкеро начинал свой путь в кино с операторской работы в сериале «Половинки» (2012) режиссером Михаила Полякова и Андрея Стрелкова. Затем он стал режиссером комедийного сериала «Тачки Рыбакина» (2012) с Андреем Рыбакиным в главной роли. Вместе с братом Антоном Андрей занимается режиссурой и дизайном. Вместе они занимаются съемками рекламных роликов.
Андрей работал сценаристом на шоу «Вечерний Ургант». В 2016 году он стал одним из режиссером фильма «Ёлки 5», производства студии Тимура Бекмамбетова «Bazelevs».
В 2021 году Андрей Шавкеро стал режиссером шоу «Эксперименты» с Александром Пушным и Даней Крастером. А также снял комедию «Старые шишки» с Алексеем Гуськовым и Ириной Алферовой.
В 2023 году Андрей Шавкеро стал режиссером комедийного детектива линейки Иви Originals – сериала «Тайна пропавшей деревни». Главные роли в сериале исполнили Мария Горбань и Филипп Ершов.