Родилась в Нью-Йорке 13 июня 1962 года. Её родители, менеджер по рекламе Джон Шиди и литературный агент Шарлотта Баум, развелись, когда Элли было 9 лет.
С 6 лет посещала студию при Американском театре балета и была уверена, что свяжет свою жизнь с танцем. Перейти к актёрскому искусству её заставила анорексия, из-за которой Элли больше не могла заниматься балетом.
После окончания частной нью-йоркской школы в 1980 году Элли решила посвятить себя кино. Её дебютной картиной стал фильм «Плохие мальчики» с Шоном Пенном, вышедший на экраны в 1983 году. После этого Элли регулярно приглашали в успешные проекты, такие, как «Клуб «Завтрак», «Военные игры» и «Огни святого Эльма». После блестящей игры в этих картинах Элли Шиди начали причислять к растущему поколению кинозвёзд вместе с Деми Мур.
Но вслед за успехом последовали и неудачи: после того как Элли снялась в нескольких фильмах, провалившихся в прокате (в их числе «Сердце Дикси» и «Служанка на заказ»), её перестали приглашать на съёмки. Голливудские деятели посчитали, что актриса не вполне соответствует тому, что принято считать начинающей кинозвездой, и почти списали её со счетов.
Агенты советовали Элли проводить больше времени в обществе успешных кинозвёзд, а также носить больше косметики и меньше одежды. Конец 1980-х стал тяжёлым для Элли. Неудачи в кино привели к булимии и зависимости от снотворного, что потребовало долгого и серьёзного лечения. Карьера актрисы считалась в то время загубленной.
После окончания лечения Элли Шиди перебралась в Нью-Йорк, где снова начала сниматься в фильмах, не выходивших в прокат или не имевших большого успеха, таких, как «Поймёт лишь одинокий», «Пропавший Капоне», «Один дома 2», «Лучший друг человека», «Дневники Красной туфельки» и другие. В 1992 году актриса вышла замуж за актёра Дэвида Лансбери, спустя два года у них родилась дочь Ребекка.
В течение нескольких лет после замужества Элли обучалась актёрскому мастерству у Гарольда Гаскина. В результате в 1998 году её пригласили на роль фотографа Люси Берлинер в картине «Высокое искусство», которую высоко оценили критики. За эту работу Элли была удостоена двух наград – «Independent Spirit Awards» и награды Национального общества кинокритиков США.
После такого успеха последовало множество ролей как в полнометражных фильмах, так и в сериалах. В настоящее время у Элли Шиди 84 завершённых проекта. Сегодня она работает над фильмом «Грехи молодости нашей», который выйдет на экраны в 2015 году.
