Родилась 20 сентября 1964 года в Гонконге. Когда Мэгги было восемь лет, она вместе с семьей переехала жить в Великобританию, а уже в возрасте восемнадцати лет приехала в Гонконг во время отпуска, где решила остаться, найдя работу в качестве модели и консультанта в салоне красоты. Через год, участвуя в конкурсе «Мисс Гонконг», Чун заняла второе место и выиграла приз за фотогеничность, что стало толчком к старту ее актерской карьеры. В 1984-м году она дебютировала в романтической комедии «Прекрасный принц», снятой Вонгом Джингом. Затем в 1985-м сыграла в картинах «За желтой линией» и «Девушка в бриллиантовой туфельке». Следующий год выдался еще более плодотворным — с ее участием вышли фильмы «Полицейская история» Джеки Чана, «Седьмое проклятие» и «Роза».
Актерская карьера Мэгги стремительно развивалась, и в 1987-м году она снялась уже в семи фильмах, среди которых «Проект А: Часть 2» и «Ты – моя судьба», а в 1988-м году отметилась в одиннадцати картинах, в том числе в «Полицейской истории 2», «Воине любви» и «Фиктивном браке». Но наибольшая известность пришла к Чун благодаря дебютной ленте Вонга Кар-Вая «Пока не высохнут слезы», с которой и началось их последующее плодотворное сотрудничество. Более того, после этой работы Мэгги стала иначе относиться к выбору фильмов, в которых снималась, и больше внимания уделяла драматическим и авторским картинам. Так, она снялась у Стэнли Квана в фильмах «Полнолуние в Нью-Йорке» и «Актриса», у Энн Хуи в «Песне изгнанников», у Клары Лау в «Прощай, Китай». Но в то же время она продолжала активно играть в популярных комедиях и боевиках.
Рекордным для Чун стал 1993-й год, когда она снялась в двенадцати фильмах. Но уже в 1994-м вышло лишь две картины с ее участием: «Прах времен» Вонга Кар-Вая и «Новый период совместной жизни» Сильвии Чан. А в 1995-м году Мэгги и вовсе решила сделать перерыв, отчасти в связи с повышенным вниманием к ее персоне со стороны прессы. Вернувшись к работе, она стала играть лишь в нескольких фильмах в год, также снимаясь и в иностранных проектах, среди которых были французские ленты «Огюстен, король кун-фу» Энн Фонтейн, «Китайская шкатулка» и «Ирма Веп» Оливье Ассайаса, с которым у Мэгги впоследствии начался роман. Кстати, актриса и режиссер поженились.
В 2000-м году на экраны вышла мелодрама Вонга Кар-Вая «Любовное настроение» с Мэгги Чун в главной роли, собравшая целый ряд наград на европейских кинофестивалях. Спустя два года с ее участием свет увидела картина Чжана Имоу «Герой», которая также была хорошо принята критиками по всему миру и номинировалась на «Оскар». К тому времени Мэгги уже рассталась со своим мужем Оливье Ассайасом, но все же снялась в 2004-м году в его фильме «Очищение», за роль в котором получила премию Каннского кинофестиваля. В том же году на экраны вышла очередная мелодрама Вонга Кар-Вая «2046», имевшая немалый успех. После этого в карьере актрисы наступил очередной перерыв, а на сегодняшний день одной из последних ее работ стала лента «Теплые летние дни», вышедшая в 2010-м году.
