Родился 1 октября 1972 года в Лондоне. Его мать была писательницей и преподавателем, а отец — бизнесменом в сфере СМИ. Еще в детстве, находясь под впечатлением от прочитанной книге о съемках кинофильма, Том загорелся мечтой стать режиссером. В возрасте тринадцати лет на взятую у дяди камеру он снял свою первую короткометражку названную «Runaway Dog» («Сбежавший пес»). Это был комедийный ролик о собаке, которая регулярно сбегала от хозяина. Спустя год был готов очередной короткометражный фильм «Bomber Jacket» («Летная куртка»), повествующий о мальчике, который узнал о том, что его дедушка погиб во время Второй Мировой войны. С этим фильмом, главная роль в котором досталась брату Тома, он выиграл второе место на конкурсе начинающих кинематографистов канала BBC. Окончив школу, Хупер взялся за съемки короткометражки «Painted Faces» («Нарисованные лица»), премьера которого прошла в рамках 35-го Лондонского кинофестиваля в 1992 году. В течение нескольких последующих лет Том преподавал английский язык в Оксфорде, снимал рекламные ролики и отметился работой над сериалом «Холодные ступни».
Новый этап в режиссерской карьере Хупера наступил в 2001 году после выхода на канале BBC снятого им сериала «Любовь в холодном климате». Вслед за этим свет увидел мини-сериал «Даниэль Деронда», а затем и полнометражные ленты «Главный подозреваемый 6: Последний свидетель» и «Красная пыль» с Хилар Суонк в главной роли. Высокие отзывы критиков получили также телевизионный фильм «Лонгфорд» и мини-сериал «Елизавета I», благодаря чему Том Хэнкс в 2008 году предложил Хуперу стать режиссером нового сериала «Джон Адамс», за который Хупер в итоге был удостоен премии «Эмми».
В 2009 году на большие экраны вышла картина «Проклятый Юнайтед», которая была тепло принята как зрителями, так и критиками. Но настоящий успех пришел к Тому спустя год, когда на экраны вышла историческая драма «Король говорит!». Она была удостоена четырех премий «Оскар», сам Хупер стал лауреатом этой престижной награды как лучший режиссер. Кроме того, картина также получила такие премии, как «Золотой глобус», «Сезар», «Гойя» и BAFTA. Последней работой Тома на текущий момент является мелодрама «Отверженные», вышедшая в 2012 году и номинированная на восемь премий «Оскар». Главные роли в этом фильме исполнили Хью Джекман, Рассел Кроу и Энн Хэтэуэй.
