Актерское образование Щербаков получил в Казанском театральном училище. После его окончания в 1990 году в течение года Владимир работал в драматическом театре г. Ульяновска. В 1991 году начинающий актер переехал в Москву и поступил в Российский университет театрального искусства, где 4 года обучался под руководством Давида Ливнева. С 1997 по 1999 годы являлся актером «Театра на Покровке».
Первые съемки в кино произошли в конце 90-х, в 1996 году он появился в фильме Владимира Мотыля «Несут меня кони», здесь Щербаков сыграл студента. С этого времени и до настоящего момента актер исполнил более 30 ролей в телесериалах и фильмах. За близкое сходство с Лаврентием Берией ему часто предлагали сыграть именно этого персонажа. Так, уже к 2010 году Владимир Щербаков снялся в образе Берии в 14 фильмах.
Наиболее успешные ленты с участием актера - фильм «Жена Сталина», сериалы «Вольф Мессинг: Видевший сквозь время», «Апостол».
