Сидоров родился 22 августа 1968 года в Северодвинске. С раннего детства Алексей проявлял жизненную любознательность и прилежание в учебе. Вплоть до восьмого класса мальчик получал в школе только отличные оценки. По окончании старших классов он подал документы в Петрозаводский университет и, преодолев с легкостью вступительные экзамены, стал студентом филологического факультета. Сидоров защитил диплом на кафедре русского языка и литературы.
В тот же период в личной жизни будущего режиссера происходили существенные перемены. В возрасте двадцати лет он принял решение жениться. Родители не слишком поощряли его намерение, так как выбор Алексея пал на девушку со сложной биографией. Невеста Лариса с большим трудом окончила вечернюю школу, а о продолжении обучения даже не шло речи. В довершение всего, органы правопорядка неоднократно уличали ее в злоупотреблении алкоголем. Вскоре после свадьбы у молодых супругов родился сын Леонид. Лариса оставалась дома с ребенком, в то время как Алексей продолжал заочное обучение и параллельно работал на заводе. К сожалению, появление малыша не изменило пагубных привычек матери. Лариса могла отлучаться из дома на несколько дней подряд. Не изменил ситуацию и переезд семьи в Петрозаводск. По причине отсутствия должного ухода за ребенком Лариса была официально лишена родительских прав. После этого Алексей, занятый профессиональной карьерой, подписал документы о переводе мальчика в детский дом.
Через некоторое время Алексей Сидоров оставил Петрозаводск и переехал в Москву, где поступил на Высшие курсы сценаристов и режиссеров. Вплоть до 1999 года он обучался в мастерской режиссера Валерия Рубинчика. Через год после выпуска Алексей дебютировал в кинематографе в качестве сценариста. Его первой работой стала драма, созданная по мотивам романа Вальтера Скотта «Граф Роберт Парижский» и вышедшая на экраны под названием «Рыцарский роман». Режиссером и исполнителем главной роли стал президент Ассоциации каскадеров России и президент Фонда развития национальных единоборств Александр Иншаков. Также в работе над лентой принимали участие Вера Сотникова, Наталья Фатеева, Василий Лановой и Любовь Полищук. Спустя пару лет Сидоров представил на суд зрителей свой первый режиссерский проект – многосерийную криминальную драму «Бригада». Сериал посвящен событиям «лихих девяностых», когда разгул преступности на постсоветском пространстве воспринимался молодым российским обществом как нормальное положение вещей. Главными героями «Бригады» являются бандиты, предприниматели и политики в одном лице. Сериал мгновенно снискал колоссальную популярность по всей стране и получил статус культового. В 2003 году проект был удостоен премии «ТЭФИ».
Спустя два года после триумфа «Бригады» Алексей приступил к съемкам криминального боевика «Бой с тенью». Главную роль в полнометражной ленте исполнил выпускник Школы-студии МХАТ Денис Никифоров. Картина имела громкий успех среди зрителей и выиграла несколько премий MTV Russia Movie Awards. Успех повлек за собой создание сиквелов «Бой с тенью 2: Реванш» и «Бой с тенью 3». В 2010 году на экраны вышел фэнтезийный триллер Антона Мегердичева «Темный мир», в работе над которым Алексей Сидоров выступил в качестве продюсера и сценариста.
